Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcirg1Q9JHF5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcirg1Q9JHF5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcirg1Q9JHF5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms