Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn12Q9ET43 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms