Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf13bQ9ET35 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf13bQ9ET35 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms