Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pgpep1Q9ESW8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pgpep1Q9ESW8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pgpep1Q9ESW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pgpep1Q9ESW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pgpep1Q9ESW8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pgpep1Q9ESW8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pgpep1Q9ESW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pgpep1Q9ESW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pgpep1Q9ESW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pgpep1Q9ESW8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pgpep1Q9ESW8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pgpep1Q9ESW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgpep1Q9ESW8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms