Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk4Q9ERK0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms