Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms