Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tfip11Q9ERA6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfip11Q9ERA6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms