Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhojQ9ER71 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RhojQ9ER71 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RhojQ9ER71 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms