Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capn12Q9ER56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn12Q9ER56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms