Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cpsf1Q9EPU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cpsf1Q9EPU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cpsf1Q9EPU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpsf1Q9EPU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms