Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clstn1Q9EPL2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn1Q9EPL2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn1Q9EPL2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn1Q9EPL2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms