Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr88Q9EPB7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gpr88Q9EPB7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.8 ms