Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Aph1cQ9DCZ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aph1cQ9DCZ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aph1cQ9DCZ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms