Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bap18Q9DCT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bap18Q9DCT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms