Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syde1Q9DBZ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syde1Q9DBZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syde1Q9DBZ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms