Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syvn1Q9DBY1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syvn1Q9DBY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms