Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ftsj3Q9DBE9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ftsj3Q9DBE9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ftsj3Q9DBE9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms