Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
March8Q9DBD2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
March8Q9DBD2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March8Q9DBD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms