Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp2aQ9DB34 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp2aQ9DB34 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms