Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem239Q9DA47 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem239Q9DA47 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms