Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smco2Q9DA21 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smco2Q9DA21 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smco2Q9DA21 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms