Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcfc2Q9D968 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc2Q9D968 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms