Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c6Q9D8P7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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