Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1Q9D883 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1Q9D883 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms