Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tspan17Q9D7W4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tspan17Q9D7W4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tspan17Q9D7W4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms