Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgm5Q9D7I9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tgm5Q9D7I9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tgm5Q9D7I9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgm5Q9D7I9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms