Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap3Q9D706 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpap3Q9D706 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpap3Q9D706 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms