Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt34Q9D646 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt34Q9D646 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt34Q9D646 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt34Q9D646 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms