Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab11fip1Q9D620 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip1Q9D620 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip1Q9D620 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms