Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc81Q9D5W4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc81Q9D5W4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc81Q9D5W4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms