Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul5Q9D5V5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul5Q9D5V5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul5Q9D5V5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms