Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447A16RikQ9D5F6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447A16RikQ9D5F6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms