Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc7Q9D541 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7Q9D541 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms