Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc130Q9D516 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc130Q9D516 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc130Q9D516 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms