Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrameQ9D4Z5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms