Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al3Q9D4U4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms