Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc105Q9D4K7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms