Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gcc1Q9D4H2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcc1Q9D4H2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcc1Q9D4H2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms