Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc6Q9D4E6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pabpc6Q9D4E6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc6Q9D4E6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms