Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krtap5-3Q9D226 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krtap5-3Q9D226 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krtap5-3Q9D226 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms