Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Necap2Q9D1J1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms