Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mrpl28Q9D1B9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl28Q9D1B9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms