Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hddc3Q9D114 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Hddc3Q9D114 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc3Q9D114 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms