Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ribc1Q9D0B8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ribc1Q9D0B8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ribc1Q9D0B8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms