Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc47Q9D024 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc47Q9D024 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc47Q9D024 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms