Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cmss1Q9CZT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmss1Q9CZT6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms