Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Shmt2Q9CZN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Shmt2Q9CZN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms