Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Thumpd2Q9CZB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms