Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nde1Q9CZA6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nde1Q9CZA6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nde1Q9CZA6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms