Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdhd3Q9CYW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms